臺灣新年數鳥嘉年華 由以下單位共同舉辦（New Year Bird Count Taiwan is jointly organized by）：
社團法人中華民國野鳥學會Taiwan Wild Bird Federation (TWBF)
成立於1988年，目前有21個團體會員，致力於鳥類棲地監測、物種保育、環境教育及國際交流合作。帶領民眾由欣賞鳥類而保育野鳥及其棲地，最終目標是「保育野鳥、保護人類、保守我們共同的未來」。
社團法人台北市野鳥學會Wild Bird Society of Taipei (WBST)
成立於1984年，以推展各類賞鳥活動來凝聚大自然保育的共識與力量。透過各項鳥類研究調查、基本資料庫建立、專業解說人才培訓，期待將生態保育理念推廣至每個人，進額建立生物和都市融合的「台北生態城」。
社團法人高雄市野鳥學會Kaohsiung Wild Bird Society (KWBS)
成立於1979年，以欣賞、研究、保育為宗旨，引領民眾親近大自然，瞭解維護生態環境的重要性，進行特定地區的生態監測，以提供學術研究及保育措施之依據，並積極參與物種及棲地的保護及復育，推動人、鳥、環境和諧共存的新世紀。
行政院農委會特有生物研究保育中心Endemic Species Research Institute (ESRI)
成立於1992年，以生物資源調查、特稀有物種生物學及生態學研究、生態教育推廣為主要任務的官方組織，是政府推動生物多樣性保育、調查、研究及推廣工作的專責機構，將於近期轉型成為生物多樣性研究所。
臺灣國家鳥類報告夥伴關係 The State of Taiwan's Birds Partnership (SOTBP)
由許多關注臺灣野鳥的NGO、學者及政府代表於2013年倡議成立，期許透過多方合作，更系統性地監測各類野鳥長期的族群動態，並以野鳥為環境指標，透過定期出版國家報告，促進生物多樣性保育。
